Địa bàn xã Minh Tân hiện nay trước đây vốn là hai xã Vĩnh Minh và Vĩnh Tân.

Trước khi sáp nhập, xã Vĩnh Minh có diện tích 6,84 km², dân số là 4.912 người, mật độ dân số đạt 718 người/km². Xã Vĩnh Tân có diện tích 6,74 km², dân số là 3.027 người, mật độ dân số đạt 449 người/km², gồm 2 làng: Bồng Trung, Đa Bút.

Ngày 16 tháng 10 năm 2019, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 786/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã thuộc tỉnh Thanh Hóa (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 12 năm 2019)[1]. Theo đó, sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của hai xã Vĩnh Minh và Vĩnh Tân thành xã Minh Tân.